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（1）Vitek-AMS 全自動鑒定系統
①工作原理
采用光電技術、電腦技術和八進位制數碼鑒定相結合。每個鑒定卡內含有30項生化反應，每三項為一組，各確立陽性反應值分別為1，2，4。如三項全部為陽性，其組值為7；如1，2項陽性為3；如1，3項陽性為5；依次類推。30項生化反應可獲取10位數和生物數碼。讀數器每隔30min 對每一試卡讀數一次，對各反應孔底物進行光掃描，動態觀察反應變化，一旦試卡內終點指示孔到達臨界值，指示反應完成，系統將后一次判讀的結果所得生物數碼與菌種庫標準菌生物模型相比較，經矩陣分析得出鑒定值和鑒定結果，并自動打印報告。
②儀器和試劑 Vitek--AMS 系統
包括以下幾個部件：充填機/封口機、讀取器/恒溫器、電腦主機及打印機組成。另需配置：比濁器；檢測卡片（由聚苯乙烯塑料制成，大小約為91mm×57mm×3.5mm）。
③操作程序
a.制備菌懸液從平板上挑取純培養物制成菌懸液用光電比濁儀比濁，配制成相當的濁度。
b.菌液接種和封閉由系統充填機/封口機自動進行。
c.培養/讀數由讀取器/恒溫器自動進行。
d.打印結果報告檢測完成后，自動打印報告。
（2）其他全自動鑒定系統
除了 Vitek-AMS 外，目前常見的全自動鑒定系統還有 MicroScan 自動鑒定系統、Sensititre 全自動微生物鑒定/藥敏測試系統，這兩種全自動鑒定系統，在光電比色的基礎上采用了熒光分析技術，使鑒定速度更快、更準確。
（3）半自動微生物鑒定系統
半自動鑒定系統，是由微量生化檢測系統發展而來。其原理也是將各種不同的生化反應組成專一鑒定試劑條（或板）。經培養后用光電讀數器自動讀數，將數據自動傳送到計算機，由計算機分析處理，并打印結果分析報告。每一系統都有其分析特點，用戶可根據需要選用。