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其廣泛應用于細胞、組織培養和某些特殊微生物的培養，常見于細胞動力學研究、哺乳動物細胞分泌物的收集、各種物理、化學因素的致癌或毒理效應、抗原的研究和生產、培養雜交瘤細胞生產抗體、體外授精（IVF）、干細胞、組織工程、篩選等研究領域。
用戶對二氧化碳培養箱都有兩條基本的要求：
一是要求二氧化碳培養箱能夠對溫度、二氧化碳濃度提供較為穩定的控制，以便于其研究工作的進展；
二是要求二氧化碳培養箱能夠對培養箱內的微生物污染進行有效的防范，并且能夠定期污染，以保護研究成果，防止樣品損失。